瘧原蟲(chóng)蛋白間相互作用
時(shí)間：2006-08-11
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了解蛋白功能的一個(gè)強(qiáng)大方法是識(shí)別那些相互結(jié)合的蛋白，因?yàn)榈鞍讖?fù)合物處在大多數(shù)生物學(xué)過(guò)程的核心。現(xiàn)在，研究人員繪制出了瘧疾寄生蟲(chóng)的1/4蛋白的蛋白間相互作用圖。這一大型數(shù)據(jù)集為了解瘧原蟲(chóng)是怎樣感染紅細(xì)胞的提供了新線索，并且將成為開(kāi)發(fā)新的抗瘧疾藥物和疫苗的一個(gè)至關(guān)重要的工具。這些原始數(shù)據(jù)可在PlasmoDB數(shù)據(jù)庫(kù)中自由獲得。Suthram等人已經(jīng)使用了這一新資源，并且發(fā)現(xiàn)瘧原蟲(chóng)網(wǎng)絡(luò)比其他真核生物的跨物種相似性明顯要小。它的新穎的生活方式反映在一個(gè)新穎的蛋白網(wǎng)絡(luò)上，后者因此有很大機(jī)會(huì)能為我們提供瘧原蟲(chóng)所獨(dú)有的藥物作用目標(biāo)。
來(lái)自霍德華休斯醫(yī)學(xué)院（Howard Hughes Medical Institute，HHMI）與Prolexys醫(yī)藥公司的研究小組繪制出了一張致死瘧疾寄生蟲(chóng)Plasmodium falciparum的蛋白相互作用物理圖譜，這是迄今為止最詳盡的瘧原蟲(chóng)蛋白相互作用圖，這一研究結(jié)果公布在了最新出版（11月3日）的Nature上。
瘧疾這一每年在全世界平均奪去270萬(wàn)人生命的超級(jí)殺手雖然針對(duì)它的研究很多，但是并沒(méi)有得到一種真正可以根除這一疾病的方法。為了獲得更詳盡的瘧疾致病信息和更好的找到有效的根治方法，來(lái)自華盛頓大學(xué)的HHMI研究員Stanley Fields與Prolexys的Robert Hughes從基因組水平研究了其蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)。
研究人員主要是利用了酵母雙雜交技術(shù)：將瘧疾病原菌蛋白基因插入到酵母細(xì)胞中并誘導(dǎo)其表達(dá)，當(dāng)兩個(gè)基因片段表達(dá)出來(lái)的蛋白會(huì)發(fā)生相互作用的時(shí)候，一個(gè)報(bào)告基因就會(huì)被與病原菌蛋白相連的調(diào)節(jié)蛋白引發(fā)表達(dá)，從而研究人員就可以記錄下這個(gè)相互作用。利用這一Prolexys公司發(fā)展的先進(jìn)技術(shù)，工作人員進(jìn)行了3萬(wàn)多個(gè)酵母雙雜篩選，并且通過(guò)另一重要技術(shù)—大規(guī)模自動(dòng)芯片分析證實(shí)了這些蛋白相互作用關(guān)系。
同時(shí)研究人員也分析了病原菌蛋白與人類蛋白的相互關(guān)系，希望可以借此多了解一些宿主細(xì)胞被感染，然后入侵以及之后的發(fā)病機(jī)理。
圖：圖片來(lái)自HHMI，人類紅細(xì)胞中瘧原蟲(chóng)（綠色）蛋白（白色）相互作用圖
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